Como dato curioso, cabe señalar el viaje del coro y la pequeña orquesta de la Catedral en 1660 a San Juan de Luz (Francia), acompañando al rey de España Felipe IV con motivo de las bodas reales de Luis XIV de Francia (el Rey Sol) con la infanta María Teresa de Austria. La Capilla ha sido y es un testigo excepcional de la historia de Navarra. No ha habido un solo acontecimiento de relevancia en la vida religiosa y aún social de Navarra sin que hayan actuado el coro y orquesta catedralicias: jura de los reyes en la Catedral, entrada de los nuevos obispos, visitas oficiales, batallas y guerras ganadas o perdidas, fiestas patronales etc.

El coro en la actualidad está compuesto por 40 componentes, todos ellos seglares, excepto el organista canónigo de la Catedral. El coro histórico con actividad diaria, incluso matutina y vespertina, compuesto fundamentalmente por clérigos (excepto los «infantes»), fue siendo sustituido paulatinamente durante la segunda mitad del s. XX por seglares. La presencia del coro polifónico se redujo al culto más solemne, teniendo una media anual de 40-50 actuaciones, la mitad en el culto catedralicio y la otra en conciertos. En la última década del siglo comenzaron sus giras artísticas por el extranjero (Roma 1991). Ha cantado en las principales catedrales y auditorios de España, así como repetidamente en algunos países: Italia, Inglaterra, Japón, Malta, Polonia, EE. UU. Suiza, Lituania, Letonia, Israel, Palestina, Alemania, o en ciudades como Estrasburgo, Bruselas, New York, París, Londres etc. En todos estos escenarios ha presentado siempre, al menos en una parte de su actuación, música española y navarra.

Ha editado un total de una veintena de CDs (coro y orquesta) y medio centenar de vídeos grabados en directo, preferentemente con música inédita del Archivo Catedral. En 2006 celebró el VIII Centenario de su fundación con diversos actos: conciertos, publicación de obras de maestros de capilla de la Seo (del s. XVI y del XXI), recuperación de instrumentos musicales a partir de la iconografía de su claustro gótico, una Exposición “Capilla de Música: 800 años” etc. En el mismo año recibió la Medalla de Oro de la Ciudad, otorgada por unanimidad por el Ayuntamiento de Pamplona. En las siguientes décadas del s. XXI ha continuado con su trayectoria de recuperación del patrimonio musical histórico propio, dándolo a conocer en escenarios locales y en el extranjero.

Desde enero de 2023 es maestro de capilla Ricardo Zoco Lampreabe, pasando el anterior titular Aurelio Sagaseta Aríztegui a responsable del Archivo de Música y canónigo maestro jubilado.